Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HKR1P10072 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HKR1P10072 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HKR1P10072 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HKR1P10072 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HKR1P10072 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HKR1P10072 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HKR1P10072 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HKR1P10072 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HKR1P10072 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HKR1P10072 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HKR1P10072 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HKR1P10072 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HKR1P10072 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HKR1P10072 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HKR1P10072 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HKR1P10072 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HKR1P10072 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HKR1P10072 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HKR1P10072 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HKR1P10072 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HKR1P10072 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HKR1P10072 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HKR1P10072 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HKR1P10072 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HKR1P10072 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HKR1P10072 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HKR1P10072 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HKR1P10072 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HKR1P10072 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HKR1P10072 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HKR1P10072 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HKR1P10072 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HKR1P10072 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HKR1P10072 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HKR1P10072 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HKR1P10072 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HKR1P10072 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HKR1P10072 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HKR1P10072 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HKR1P10072 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HKR1P10072 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HKR1P10072 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HKR1P10072 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HKR1P10072 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HKR1P10072 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HKR1P10072 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HKR1P10072 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HKR1P10072 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms