Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM225BP0DP42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM225BP0DP42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM225BP0DP42 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms