Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC192P0DO97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC192P0DO97 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC192P0DO97 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC192P0DO97 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC192P0DO97 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms