Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMIGD3P0DMS9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD3P0DMS9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIGD3P0DMS9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms