Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGA3P0DJD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PGA3P0DJD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PGA3P0DJD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms