Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR29P0C7W0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms