Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYNP07948 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYNP07948 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYNP07948 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNP07948 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNP07948 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNP07948 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNP07948 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNP07948 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNP07948 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYNP07948 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYNP07948 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNP07948 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNP07948 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNP07948 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYNP07948 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNP07948 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNP07948 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNP07948 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNP07948 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYNP07948 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYNP07948 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNP07948 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNP07948 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNP07948 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNP07948 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNP07948 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNP07948 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYNP07948 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYNP07948 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYNP07948 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LYNP07948 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LYNP07948 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNP07948 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LYNP07948 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms