Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL1P05976 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL1P05976 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL1P05976 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYL1P05976 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYL1P05976 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYL1P05976 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYL1P05976 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYL1P05976 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL1P05976 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL1P05976 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL1P05976 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL1P05976 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL1P05976 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL1P05976 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYL1P05976 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL1P05976 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL1P05976 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL1P05976 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL1P05976 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYL1P05976 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYL1P05976 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYL1P05976 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYL1P05976 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYL1P05976 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYL1P05976 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYL1P05976 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYL1P05976 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL1P05976 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL1P05976 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL1P05976 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL1P05976 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL1P05976 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYL1P05976 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL1P05976 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL1P05976 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL1P05976 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL1P05976 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL1P05976 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYL1P05976 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYL1P05976 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYL1P05976 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYL1P05976 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYL1P05976 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYL1P05976 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYL1P05976 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL1P05976 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL1P05976 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL1P05976 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL1P05976 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL1P05976 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL1P05976 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYL1P05976 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYL1P05976 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYL1P05976 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYL1P05976 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYL1P05976 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYL1P05976 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYL1P05976 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYL1P05976 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms