Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT1P04264 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT1P04264 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT1P04264 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT1P04264 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT1P04264 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT1P04264 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT1P04264 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT1P04264 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT1P04264 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT1P04264 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT1P04264 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT1P04264 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT1P04264 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT1P04264 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT1P04264 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT1P04264 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT1P04264 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT1P04264 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT1P04264 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT1P04264 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT1P04264 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT1P04264 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT1P04264 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT1P04264 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT1P04264 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT1P04264 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT1P04264 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT1P04264 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT1P04264 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT1P04264 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT1P04264 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT1P04264 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT1P04264 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT1P04264 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT1P04264 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT1P04264 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT1P04264 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT1P04264 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT1P04264 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT1P04264 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT1P04264 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT1P04264 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT1P04264 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT1P04264 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT1P04264 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT1P04264 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT1P04264 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT1P04264 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT1P04264 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT1P04264 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT1P04264 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT1P04264 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT1P04264 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT1P04264 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT1P04264 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT1P04264 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT1P04264 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT1P04264 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT1P04264 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT1P04264 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT1P04264 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT1P04264 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT1P04264 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT1P04264 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT1P04264 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT1P04264 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT1P04264 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT1P04264 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT1P04264 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT1P04264 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT1P04264 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT1P04264 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT1P04264 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT1P04264 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT1P04264 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT1P04264 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT1P04264 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT1P04264 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT1P04264 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT1P04264 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT1P04264 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT1P04264 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT1P04264 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT1P04264 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT1P04264 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT1P04264 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT1P04264 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT1P04264 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT1P04264 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT1P04264 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT1P04264 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms