Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD74P04233 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD74P04233 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CD74P04233 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CD74P04233 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD74P04233 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CD74P04233 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD74P04233 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD74P04233 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD74P04233 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD74P04233 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD74P04233 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD74P04233 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD74P04233 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD74P04233 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD74P04233 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD74P04233 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD74P04233 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD74P04233 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD74P04233 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD74P04233 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD74P04233 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD74P04233 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD74P04233 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD74P04233 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD74P04233 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD74P04233 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD74P04233 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD74P04233 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD74P04233 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD74P04233 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD74P04233 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD74P04233 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD74P04233 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD74P04233 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD74P04233 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD74P04233 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD74P04233 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD74P04233 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD74P04233 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD74P04233 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD74P04233 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD74P04233 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD74P04233 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms