Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DRAP01903 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-DRAP01903 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DRAP01903 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms