Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTAP01374 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTAP01374 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTAP01374 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTAP01374 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTAP01374 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTAP01374 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTAP01374 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTAP01374 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTAP01374 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTAP01374 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTAP01374 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LTAP01374 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LTAP01374 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LTAP01374 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTAP01374 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTAP01374 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTAP01374 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LTAP01374 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LTAP01374 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LTAP01374 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LTAP01374 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTAP01374 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTAP01374 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTAP01374 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTAP01374 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTAP01374 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LTAP01374 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LTAP01374 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTAP01374 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTAP01374 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTAP01374 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTAP01374 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTAP01374 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTAP01374 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LTAP01374 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LTAP01374 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTAP01374 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTAP01374 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTAP01374 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LTAP01374 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms