Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFB1P01137 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFB1P01137 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFB1P01137 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms