Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
F2P00734 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
F2P00734 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
F2P00734 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F2P00734 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F2P00734 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F2P00734 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F2P00734 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
F2P00734 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
F2P00734 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
F2P00734 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
F2P00734 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
F2P00734 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
F2P00734 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
F2P00734 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F2P00734 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F2P00734 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F2P00734 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F2P00734 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
F2P00734 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
F2P00734 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
F2P00734 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
F2P00734 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
F2P00734 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
F2P00734 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
F2P00734 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F2P00734 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F2P00734 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F2P00734 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F2P00734 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F2P00734 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
F2P00734 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
F2P00734 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
F2P00734 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
F2P00734 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
F2P00734 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
F2P00734 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F2P00734 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
F2P00734 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F2P00734 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
F2P00734 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
F2P00734 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F2P00734 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F2P00734 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
F2P00734 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
F2P00734 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F2P00734 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F2P00734 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F2P00734 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F2P00734 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F2P00734 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F2P00734 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F2P00734 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F2P00734 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
F2P00734 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F2P00734 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F2P00734 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F2P00734 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F2P00734 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F2P00734 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F2P00734 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F2P00734 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F2P00734 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms