Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHEK2O96017 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHEK2O96017 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHEK2O96017 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms