Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC24BO95487 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SEC24BO95487 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC24BO95487 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms