Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOBTB3O94955 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOBTB3O94955 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RHOBTB3O94955 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOBTB3O94955 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms