Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG12O94817 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG12O94817 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG12O94817 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG12O94817 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG12O94817 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG12O94817 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG12O94817 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG12O94817 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG12O94817 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG12O94817 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATG12O94817 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG12O94817 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG12O94817 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG12O94817 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG12O94817 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG12O94817 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG12O94817 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG12O94817 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG12O94817 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG12O94817 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG12O94817 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG12O94817 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG12O94817 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG12O94817 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG12O94817 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG12O94817 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG12O94817 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG12O94817 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG12O94817 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG12O94817 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG12O94817 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG12O94817 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG12O94817 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG12O94817 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG12O94817 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG12O94817 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG12O94817 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG12O94817 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG12O94817 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG12O94817 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG12O94817 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG12O94817 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG12O94817 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG12O94817 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG12O94817 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms