Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH4O75427 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRCH4O75427 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRCH4O75427 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms