Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VEGFDO43915 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFDO43915 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VEGFDO43915 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VEGFDO43915 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms