Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRS3O43559 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRS3O43559 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRS3O43559 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRS3O43559 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRS3O43559 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRS3O43559 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRS3O43559 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRS3O43559 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRS3O43559 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRS3O43559 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRS3O43559 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRS3O43559 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRS3O43559 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRS3O43559 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRS3O43559 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRS3O43559 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRS3O43559 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRS3O43559 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRS3O43559 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRS3O43559 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRS3O43559 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRS3O43559 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRS3O43559 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRS3O43559 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRS3O43559 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRS3O43559 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRS3O43559 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FRS3O43559 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRS3O43559 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRS3O43559 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRS3O43559 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRS3O43559 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRS3O43559 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FRS3O43559 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRS3O43559 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRS3O43559 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRS3O43559 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRS3O43559 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRS3O43559 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRS3O43559 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRS3O43559 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRS3O43559 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRS3O43559 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRS3O43559 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRS3O43559 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRS3O43559 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRS3O43559 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRS3O43559 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRS3O43559 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRS3O43559 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRS3O43559 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRS3O43559 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRS3O43559 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRS3O43559 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms