Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR5O43504 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMTOR5O43504 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR5O43504 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMTOR5O43504 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms