Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1GO43497 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1GO43497 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1GO43497 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1GO43497 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.3 ms