Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTSS1O43312 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTSS1O43312 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTSS1O43312 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms