Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRODHO43272 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRODHO43272 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRODHO43272 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRODHO43272 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRODHO43272 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRODHO43272 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRODHO43272 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRODHO43272 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRODHO43272 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRODHO43272 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRODHO43272 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRODHO43272 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRODHO43272 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRODHO43272 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRODHO43272 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRODHO43272 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRODHO43272 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRODHO43272 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRODHO43272 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRODHO43272 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRODHO43272 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRODHO43272 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRODHO43272 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRODHO43272 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRODHO43272 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRODHO43272 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRODHO43272 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRODHO43272 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRODHO43272 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRODHO43272 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms