Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD3O43242 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD3O43242 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMD3O43242 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms