Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRXO43186 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRXO43186 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRXO43186 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRXO43186 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRXO43186 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRXO43186 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRXO43186 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRXO43186 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRXO43186 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRXO43186 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRXO43186 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRXO43186 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRXO43186 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRXO43186 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRXO43186 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRXO43186 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRXO43186 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRXO43186 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRXO43186 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms