Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHGDHO43175 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHGDHO43175 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHGDHO43175 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms