Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PJA2O43164 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PJA2O43164 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA2O43164 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA2O43164 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA2O43164 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA2O43164 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PJA2O43164 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA2O43164 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA2O43164 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA2O43164 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA2O43164 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA2O43164 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA2O43164 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PJA2O43164 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA2O43164 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA2O43164 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA2O43164 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA2O43164 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PJA2O43164 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PJA2O43164 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA2O43164 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA2O43164 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA2O43164 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA2O43164 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA2O43164 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PJA2O43164 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PJA2O43164 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA2O43164 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA2O43164 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA2O43164 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PJA2O43164 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PJA2O43164 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PJA2O43164 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PJA2O43164 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PJA2O43164 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA2O43164 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA2O43164 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA2O43164 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA2O43164 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PJA2O43164 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PJA2O43164 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PJA2O43164 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA2O43164 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA2O43164 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA2O43164 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PJA2O43164 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms