Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBDO15205 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBDO15205 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBDO15205 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBDO15205 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBDO15205 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBDO15205 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBDO15205 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBDO15205 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBDO15205 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBDO15205 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBDO15205 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBDO15205 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBDO15205 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBDO15205 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBDO15205 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBDO15205 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBDO15205 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBDO15205 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBDO15205 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBDO15205 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBDO15205 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBDO15205 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBDO15205 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBDO15205 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBDO15205 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBDO15205 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBDO15205 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBDO15205 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBDO15205 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBDO15205 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBDO15205 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBDO15205 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBDO15205 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBDO15205 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBDO15205 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBDO15205 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBDO15205 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBDO15205 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBDO15205 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms