Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSPLO15194 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPLO15194 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTDSPLO15194 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms