Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DYNC1I1O14576 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DYNC1I1O14576 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DYNC1I1O14576 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms