Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CXCR6O00574 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR6O00574 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms