Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SPPL3-207ENST00000543608 636 ntTSL 316.44■□□□□ 0.229e-11■■■■■ 53.1
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DDX3XO00571 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.129e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 SPPL3-204ENST00000536996 763 ntTSL 515.09■□□□□ 0.019e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-213ENST00000566614 561 ntTSL 414.75□□□□□ -0.059e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NDUFAF7-205ENST00000431821 783 ntTSL 414.44□□□□□ -0.19e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.129e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-209ENST00000565065 634 ntTSL 513.88□□□□□ -0.199e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NDUFAF7-202ENST00000336237 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.239e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-221ENST00000570289 546 ntTSL 412.44□□□□□ -0.429e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.439e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 DUSP3-205ENST00000591618 538 ntTSL 311.92□□□□□ -0.59e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NDUFAF7-211ENST00000474154 2974 ntTSL 211.31□□□□□ -0.69e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 STAT1-204ENST00000409465 3097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.769e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 NARFL-217ENST00000567455 510 ntTSL 49.55□□□□□ -0.889e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 DUSP3-204ENST00000590935 3666 ntTSL 59.28□□□□□ -0.929e-11■■■■■ 53.1
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DDX3XO00571 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.139e-11■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-31■■■■■ 53.1
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DDX3XO00571 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.299e-18■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 SEH1L-209ENST00000592170 787 ntTSL 511.18□□□□□ -0.629e-18■■■■■ 53.1
DDX3XO00571 CRELD2-209ENST00000483652 1994 ntTSL 1 (best)21.11■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 53
DDX3XO00571 CRELD2-206ENST00000450207 963 ntTSL 519.08■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 53
DDX3XO00571 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.37e-7■■■■■ 53
DDX3XO00571 SAP30-202ENST00000504618 410 ntTSL 317.41■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 53
DDX3XO00571 TP53TG1-201ENST00000359941 855 ntTSL 1 (best)18.49■□□□□ 0.559e-11■■■■■ 52.9
DDX3XO00571 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.549e-11■■■■■ 52.9
DDX3XO00571 TP53TG1-205ENST00000542586 685 ntTSL 418.41■□□□□ 0.549e-11■■■■■ 52.9
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DDX3XO00571 TP53TG1-203ENST00000421293 439 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.699e-11■■■■■ 52.9
DDX3XO00571 TP53TG1-206ENST00000610086 849 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.749e-11■■■■■ 52.9
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DDX3XO00571 RDH11-202ENST00000428130 1064 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 52.9
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DDX3XO00571 MPZL1-210ENST00000487858 420 ntTSL 415.56■□□□□ 0.084e-47■■■■■ 52.9
DDX3XO00571 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.039e-17■■■■■ 52.9
DDX3XO00571 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-19■■■■■ 52.8
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DDX3XO00571 ITFG1-206ENST00000563730 550 ntTSL 46.87□□□□□ -1.312e-19■■■■■ 52.8
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DDX3XO00571 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 52.6
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DDX3XO00571 P4HA2-208ENST00000416053 582 ntTSL 36.8□□□□□ -1.328e-8■■■■■ 52.6
DDX3XO00571 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.569e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.569e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TBCB-204ENST00000481742 904 ntTSL 223.67■■□□□ 1.382e-22■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TBCB-202ENST00000392178 791 ntTSL 223.59■■□□□ 1.372e-22■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.379e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.369e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 THAP7-AS1-201ENST00000429962 1263 ntTSL 1 (best)22.19■■□□□ 1.149e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.082e-22■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.949e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TBCB-213ENST00000593075 605 ntTSL 320.92■□□□□ 0.944e-35■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TARSL2-202ENST00000539112 2774 ntTSL 1 (best)20.32■□□□□ 0.849e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-22■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.779e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 THAP7-AS1-202ENST00000436079 1720 ntTSL 219.54■□□□□ 0.729e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.689e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-22■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.169e-12■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TBCB-212ENST00000591296 399 ntTSL 311.13□□□□□ -0.632e-22■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-15■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.166e-15■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TMEM179B-204ENST00000532586 839 ntTSL 216.59■□□□□ 0.256e-15■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.246e-15■■■■■ 52.5
DDX3XO00571 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 CFDP1-205ENST00000565646 608 ntTSL 313.47□□□□□ -0.256e-12■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.276e-12■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 CFDP1-207ENST00000566901 1167 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.276e-12■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 CFDP1-203ENST00000564286 775 ntTSL 510.49□□□□□ -0.736e-12■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 CFDP1-206ENST00000566254 342 ntTSL 38.75□□□□□ -1.019e-12■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 SLC25A36-215ENST00000631654 620 ntTSL 514.31□□□□□ -0.123e-19■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 52.4
DDX3XO00571 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 52.3
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1684.9 ms