Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFXAPO00287 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFXAPO00287 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFXAPO00287 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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