Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGRMC1O00264 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGRMC1O00264 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGRMC1O00264 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms