Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NFKBIEO00221 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFKBIEO00221 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFKBIEO00221 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NFKBIEO00221 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFKBIEO00221 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms