Protein–RNA interactions for Protein: O00219

HAS3, Hyaluronan synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAS3O00219 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HAS3O00219 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HAS3O00219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HAS3O00219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HAS3O00219 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HAS3O00219 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HAS3O00219 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HAS3O00219 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HAS3O00219 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HAS3O00219 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HAS3O00219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HAS3O00219 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HAS3O00219 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HAS3O00219 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HAS3O00219 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HAS3O00219 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HAS3O00219 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HAS3O00219 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HAS3O00219 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HAS3O00219 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HAS3O00219 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HAS3O00219 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HAS3O00219 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HAS3O00219 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HAS3O00219 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HAS3O00219 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HAS3O00219 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HAS3O00219 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HAS3O00219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HAS3O00219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HAS3O00219 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HAS3O00219 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HAS3O00219 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HAS3O00219 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HAS3O00219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HAS3O00219 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HAS3O00219 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HAS3O00219 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HAS3O00219 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HAS3O00219 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HAS3O00219 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HAS3O00219 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HAS3O00219 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HAS3O00219 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HAS3O00219 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HAS3O00219 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HAS3O00219 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HAS3O00219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HAS3O00219 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HAS3O00219 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HAS3O00219 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HAS3O00219 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HAS3O00219 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HAS3O00219 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HAS3O00219 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HAS3O00219 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HAS3O00219 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HAS3O00219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HAS3O00219 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HAS3O00219 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HAS3O00219 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HAS3O00219 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HAS3O00219 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HAS3O00219 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HAS3O00219 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms