Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARVCFO00192 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARVCFO00192 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARVCFO00192 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ARVCFO00192 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms