Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms