Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
I3L3M4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
I3L3M4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
I3L3M4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
I3L3M4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
I3L3M4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
I3L3M4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
I3L3M4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
I3L3M4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
I3L3M4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
I3L3M4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
I3L3M4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
I3L3M4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
I3L3M4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
I3L3M4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
I3L3M4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
I3L3M4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
I3L3M4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
I3L3M4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
I3L3M4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
I3L3M4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
I3L3M4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
I3L3M4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
I3L3M4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
I3L3M4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
I3L3M4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
I3L3M4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
I3L3M4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
I3L3M4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
I3L3M4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
I3L3M4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
I3L3M4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
I3L3M4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
I3L3M4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms