Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA8SH3BPF8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA8SH3BPF8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA8SH3BPF8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA8SH3BPF8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms