Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRDCB7Z8K6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRDCB7Z8K6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms