Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERVV-1B6SEH8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERVV-1B6SEH8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVV-1B6SEH8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVV-1B6SEH8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
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