Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF487B1APH4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF487B1APH4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF487B1APH4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms