Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTLL13PA6NNM8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL13PA6NNM8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL13PA6NNM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL13PA6NNM8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms