Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN8A6NHC0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN8A6NHC0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms