Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERINC4A6NH21 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SERINC4A6NH21 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERINC4A6NH21 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms