Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L3A6NCW0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L3A6NCW0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L3A6NCW0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP17L3A6NCW0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms