Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RNF222A6NCQ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF222A6NCQ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF222A6NCQ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms